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단백체분석팀

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단백질 및 펩타이드 분리를 위한 다양한 플랫폼과 최신질량분석기술을 기반으로 세포를 구성하는 단백질의 정성, 정량분석을 통해 단백체 및 대사체 상호작용에 대한 연구를 지원

단백질 동정

발현에 차이를 보이는 단백질을 분리하여 펩타이드로 가수분해 후, 질량분석정보를 이용하여 단백질을 동정하는 방법

그림 설명 : 관심있는 단백질을 Electrophoresis, co-immunoprecipitation, pull down 방법 등을 이용해 분리한 후 펩타이드로 가수분해한 후, 질량분석기를 이용하여 스펙트럼을 얻고, 데이터베이스 매칭을 통해 단백질을 동정함.

표지 단백체 프로파일링

Tandem Mass Tag(TMT) isobaric reagent를 펩타이드에 표지하여 서로 다른 2~16개의 시료를 동시에 비교 분석할 수 있는 질량 분석방법으로 정확한 상대 정량이 가능한 방법

그림 설명

  • 혈액, 조직 등 생체시료에서 단백질이 손상되지 않게 고효율로 추출함.
  • 서로 다른 시료를 각각 펩타이드로 가수분해함.
  • TMT 또는 TMTpro isobaric reagent를 각각의 펩타이드에 넣어 서로 다르게 표지함.
  • 서로 다르게 표지된 펩타이드를 하나로 합친 후, 액체크로마토 그래피를 이용해 분리함.
  • 질량분석기를 이용하여 정량, 정성을 위한 스펙트럼을 얻음.

비표지 단백체 프로파일링

고성능/고분해능의 질량분석기를 이용하여 생체 시료들 사이에 존재하는 단백질의 차이를 비교 분석하여 시료별 단백질의 특성을 찾아내고 이를 통해 바이오마커를 발굴할 수 있는 방법

그림 설명 : 대조군과 환자군의 혈액, 조직 등의 생체시료를 액체크로마토그래피-질량분석기를 이용하여 분석한 후, 두 그룹 사이에 발현에 차이가 나는 단백질을 찾아내고 이를 통해 바이오마커를 발굴할 수 있음.